バイオインフォマティクスブログテーマ

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このコミュが盛んになり、バイオインフォマティクスが一般にも幅広く浸透すればいいなと思っています。

管理人：dynaさん


	08/11/02 21:50:56BioPerlで塩基配列を扱ってみようこの実習では塩基配列をアミノ酸配列への翻訳を行います。いままでずっと、アミノ酸配列を扱ってきたので、気分転換に塩基配列を扱ってみたいと思います。基本的には変わり... バイオ　やばいぉ・・・
	08/11/02 21:50:44魚類写真資料データベース魚類写真資料データベースhttp://research.kahaku.go.jp/zoology/photoDB/このデータベースには魚類の生態写真や標本写真が含まれています。バイオ　やばいぉ・・・
	08/11/01 22:29:42蛍光色を発する絹糸-遺伝子組み換えカイコ毎日.jpより遺伝子組み換えカイコを使い、緑や赤、オレンジの蛍光色を発する絹糸を作り出すことに、農業生物資源研究所（茨城県つくば市）などの研究チームが２４日、世界... バイオ　やばいぉ・・・
	08/11/01 22:29:36ncRNA ノンコーディングRNA（non-coding RNA、ncRNA、非コードRNA）とはタンパク質へ翻訳されずに機能するRNAの総称・ヒトらしさを決めるncRNAヒトとヒトに最も近縁な生物である... バイオ　やばいぉ・・・
	08/11/01 22:29:32エピジェネティクスエピジェネティクス(epigenetics)とは　ゲノムDNA配列の変化を伴わず，遺伝子発現を選択的に活性化・不活性化する機構により，遺伝的情報が子孫または娘細胞に伝達される現... バイオ　やばいぉ・・・
	08/11/01 22:29:29Sequence Manipulation Suite Sequence Manipulation Suite(SMS)　DNA情報のReverse+Complement、タンパク質への翻訳の際の正しいフレーム探し、アミノ酸の1文字表記を3文字表記にするといったちょっと... バイオ　やばいぉ・・・
	08/11/01 22:29:26UCSC Genome Bioinformatics UCSC Genome Bioinformatics　http://genome.ucsc.edu/いろいろな事ができるサイト。【一例】PCRでゲノムが増幅されるとどのくらいの大きさになるか？エクソン、イントロン... バイオ　やばいぉ・・・
	08/11/01 22:29:10BioPerlのマニュアル、チュートリアルをみよう BioPerlのマニュアルをみて勉強を進めましょう。コマンドプロンプトを起動したらperldoc Bio::Perlを入力して実行してみましょう。このperldocという命令はその後に、マニ... バイオ　やばいぉ・・・
	08/11/01 22:29:07BioPerlで分子量を計算してみようこの実習では、タンパク質の分子量の計算を行います。分子量を計算するためには、use Bio::Perlに加えて、use Bio::Tools::SeqStats;の記述をします。use Bio::Tools::SeqS... バイオ　やばいぉ・・・
	08/11/01 22:29:03BioPerlでBLASTを使ってみよう今回の実習では、データベースから取ってきたタンパク質にBLASTをかけて、その結果を　roa1.blast というファイルに出力するということを行いたいと思います。まずはテキス... バイオ　やばいぉ・・・

	08/11/01 22:28:59データベースから配列をとってこようまずは、Genbankのデータベースからタンパク質のデータを取ってくるという実習をしましょう。それではテキストエディタを開いて下記をコピペ（コピーして貼り付け）してく... バイオ　やばいぉ・・・
	08/11/01 22:28:56アミノ酸コード表アミノ酸コード表Ala A AlanineArg R ArginineAsn N AsparagineAsp D Aspartic acidCys C CysteineGln Q GlutamineGlu E Glutamic acidGly G GlycineHis ... バイオ　やばいぉ・・・
	08/10/26 22:04:57次々読み取られるゲノム配列ヒトゲノムプロジェクトが進行するのと平行に、様々な生物のゲノムプロジェクトが進んでいきました。現在では、ショウジョウバエやシロイヌナズナなどの代表的な実験生物（... バイオ　やばいぉ・・・
	08/10/26 22:04:54遺伝子システムの理解遺伝子DNAはどのように親から子へ伝わり、細胞の中で働いているのか？この謎を解く突破口となったのは、 DNAの二重らせん構造の解明です。20世紀の半ばには、 DNAが正確に... バイオ　やばいぉ・・・
	08/10/26 22:04:49遺伝子という考え方の確立親と子が似ている（しかし全く同じではない）という現象を説明するために、昔から様々な説が考え出されてきました。メンデルは、遺伝に関わる要素（遺伝子）の存在を仮定し... バイオ　やばいぉ・・・
	08/10/26 22:04:47遺伝子解析技術の発展いろいろな生きものの遺伝子の働きを研究するためには、生きものから取り出したDNAを手軽に切ったりつなげたり増やしたりできる技術が必要です。1972年の組み換えDNA法を始... バイオ　やばいぉ・・・
	08/10/26 22:04:43ヒトゲノムプロジェクトの始動遺伝子の働きを調べる研究はどんどん盛んになり、この生命現象にはどんな遺伝子が関わっているのか？この遺伝子はどんな生命現象に関わっているのか？ということが次第に分... バイオ　やばいぉ・・・
	08/10/26 22:04:37ヒトゲノムを使った実験教室「私たちのDNA」【日時】： 2008年11月29日（土）【場所】：東京農工大学農学部遺伝子実験施設（東京都府中市幸町3-5-8）【持ち物】：筆記具　受講票【参加費】： 2,000円（資料代、... バイオ　やばいぉ・・・
	08/10/26 22:04:32第3回メタボロームシンポジウム * 日時：2008年10月30日（木）14:00-11月1日（土）12:00 （観光ツアー「芭蕉が訪ねた奥の細道」11/1（土）12:00-17:00） * 場所：慶應義塾大学先端生命科学研究所... バイオ　やばいぉ・・・
	08/10/26 22:04:27「ｉＰＳ細胞から生殖細胞」はOK YOMIURI ONLINEより　文部科学省の専門委員会は人間のES細胞やiPS細胞などから精子や卵子を作製する研究について認めるという方針を出しています。　　これは生殖細胞の性... バイオ　やばいぉ・・・
	08/10/26 22:04:22ゲノムの個人差-SNP- ゲノムの個人差ヒトゲノムの解読が進むことによって、私たちのゲノムは99．9パーセントが共通で、個人差は約0．1パーセントだということがわかってきました。ゲノムの0．1... バイオ　やばいぉ・・・
	08/10/26 22:04:18windowsXPにBioPerlをインストールしよう windowsでBioPerlをインストールするには２段階ステップを踏む必要があります。１） ActivePerl のインストール２） BioPerl のインストールです。１） ActivePerl のイン... バイオ　やばいぉ・・・
	08/10/19 02:22:54進化しすぎた脳 - 本の紹介 - 脳に興味がある全ての人にオススメの一冊です。脳科学者が高校生に語るこの本の著者は、東京大学で脳の研究を行っている池谷裕二さん。この池谷さんが、ニューヨークの高校... 今を生きる
	08/10/17 00:22:59カロリーの摂り過ぎが脳を狂わせる可能性＝研究 exciteニュースより過食は脳を混乱させてさまざまな損傷を引き起こし、糖尿病や心臓病その他の疾患の原因をつくる可能性があるという研究結果が発表されたそうです。　米ウ... バイオ　やばいぉ・・・
	08/10/17 00:16:35Biological Sequence Analysis: Probabilistic Models of Proteins and Nucleic Acids Biological Sequence Analysis: Probabilistic Models of Proteins and Nucleic Acidsposted with amazlet at 08.10.16Richard Durbin Sean R. Eddy Anders Krogh Graeme M... バイオ　やばいぉ・・・
	08/10/17 00:16:33バイオインフォマティクス基礎講義―一歩進んだ発想をみがくためにバイオインフォマティクス基礎講義―一歩進んだ発想をみがくためにposted with amazlet at 08.10.16アーサー・M. レスクメディカルサイエンスインターナショナル売り上げ... バイオ　やばいぉ・・・
	08/10/17 00:16:31バイオインフォマティクスゲノム配列から機能解析へ第2版 Bioinformatics: Sequence and Genome Analysisposted with amazlet at 08.10.16David W. Mount Cold Spring Harbor Laboratory Pr 売り上げランキング: 62159おすすめ度の... バイオ　やばいぉ・・・
	08/10/17 00:16:28Bioinformatics: A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins (Methods of Biochemical Analysis, V. 43) Bioinformatics: A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins (Methods of Biochemical Analysis, V. 43)posted with amazlet at 08.10.16B. F. Francis Oue... バイオ　やばいぉ・・・
	08/10/17 00:16:23バイオデータベースとウェブツールの手とり足とり活用法改訂第2版バイオデータベースとウェブツールの手とり足とり活用法 ― 遺伝子の配列・機能解析、タンパク質解析、プロテオミクス、文献検索、検索エンジン…etc.真に役立つ... バイオ　やばいぉ・・・
	08/10/17 00:16:20できるバイオインフォマティクスできるバイオインフォマティクスposted with amazlet at 08.10.16広川貴次美宅成樹中山書店売り上げランキング: 388809おすすめ度の平均: 解説が丁寧とにかく使える... バイオ　やばいぉ・・・
	08/10/17 00:16:17バイオインフォマティクスがわかるバイオインフォマティクスがわかる (わかる実験医学シリーズ)posted with amazlet at 08.10.16羊土社売り上げランキング: 797535おすすめ度の平均: 情報系には理解困難 ... バイオ　やばいぉ・・・
	08/10/17 00:16:14ゲノム情報はこう活かせ！ゲノム情報はこう活かせ!―比較ゲノム学を遺伝子・タンパク質の機能解析や疾患遺伝子探索に活用する方法がわかるposted with amazlet at 08.10.16岡崎康司坊農秀雅羊土... バイオ　やばいぉ・・・
	08/10/17 00:16:10バイオ研究が１０倍はかどるMac OS X活用マニュアルバイオ研究が10倍はかどるMacOS X活用マニュアル―セットアップから超簡単データ解析までposted with amazlet at 08.10.16中村保一荻島創一礒合敦羊土社売り上げラ... バイオ　やばいぉ・・・
	08/10/16 00:54:37プログラミングの力を生み出す本―インテルCPUのGNUユーザへプログラミングの力を生み出す本―インテルCPUのGNUユーザへposted with amazlet at 08.10.13橋本洋志松永俊雄冨永和人石井千春オーム社売り上げランキング: 2710... バイオ　やばいぉ・・・
	08/10/16 00:54:36ゲノム情報生物学―BioinformaticsとInformation Biology (ポストシークエンスのゲノム科学) ゲノム情報生物学―BioinformaticsとInformation Biology (ポストシークエンスのゲノム科学)posted with amazlet at 08.10.13松原謙一榊佳之中山書店売り上げランキン... バイオ　やばいぉ・・・

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